独角仙的种类繁多,目前已被发现的具有大型犄角的独角仙有60多种,而犄角较小或不明显的种类则多达一千三百多种。常见的品种包括双叉犀金龟、姬兜、印尼姬兜、马来西亚姬兜等。
此外,根据地域划分,独角仙也有多个亚种,如独角仙指名亚种、独角仙日本亚种等。这些种类和亚种在形态和习性上各有特点,丰富了独角仙的多样性。